Реших проблема. title колоната се връщаше от SQLAlchemy като str а не Unicode .Мислех да добавя encoding='utf8' като аргумент за create_engine ще се погрижи за това, но правилният начин да го направите е да го предадете в URI на базата данни:mysql://example@sqldat.com/mydatabase?charset=utf8 .
Благодаря ви за всичките ви отговори!