Как да проверя дали MySQL таблицата е UTF-8 и има storageEngine InnoDB?

Можете да използвате information_schema, за да знаете двигателя на всяка таблица.

select table_name,engine 
from information_schema.tables
where table_schema = 'your_database'

За кодирането можете да използвате

show create table table_name

или още по-добре

select 
c.character_set_name 
from information_schema.tables as t,
     information_schema.collation_character_set_applicability as c
where c.collation_name = t.table_collation
and t.table_schema = "your_db"
and t.table_name = "table_name";