Как да направя зададен от MySQL и PHP?

Опитайте това:

    echo '<select>';
$tempholder = array();
$rs = mysql_query("SELECT * FROM id ORDER BY year");
$nr = mysql_num_rows($rs);
for ($i=0; $i<$nr; $i++){
    $r = mysql_fetch_array($rs);
    if (!in_array($r['year'], $tempholder)){
        $tempholder[$i] = $r['year'];
        echo "<option".(($year==$r["year"])? ' selected="selected"' : '').">".$r["year"]."</option>";
    }
}
unset($tempholder);
echo '</select>';

Той не записва състоянието в променлива, която трябва да презапишете.

И мисля, че истинската грешка беше единичният знак за равенство в $year=$r["year"], а не в останалата част от кода.