Разширението mysql е древно и съществува от PHP 2.0, издаден преди 15 години (!!); който е категорично различен звяр от съвременния PHP, който се опитва да изхвърли лошите практики от миналото си. Разширението mysql е много необработен конектор на ниско ниво към MySQL, който няма много функции за удобство и поради това е труден за правилно приложение по сигурен начин; следователно е лошо за нубите. Много разработчици не разбират SQL инжектирането и mysql API е достатъчно крехък, за да затрудни предотвратяването му, дори ако сте наясно с това. Той е пълен с глобално състояние (например неявно преминаване на връзка), което улеснява писането на код, който е труден за поддържане. Тъй като е остарял, може да е неоправдано трудно да се поддържа на ниво ядро на PHP.
Разширението mysqli е много по-ново и коригира всички горепосочени проблеми. PDO също е доста нов и коригира всички тези проблеми, плюс още.
Поради тези причини* разширението mysql ще бъде премахнато някъде в бъдеще. Свърши работата си в разцвета си, доста зле, но го свърши. Времето напредва, най-добрите практики се развиха, приложенията станаха по-сложни и изискват по-модерен API. mysql се пенсионира, живейте с него.
Предвид всичко това, няма причина за да продължите да го използвате освен по инерция.
* Това са моите обобщени причини за здравия разум; за цялата официална история вижте тук:https://wiki.php.net/rfc/mysql_deprecation
Следват цитати за избор от този документ: