Проблемът е с PHP адаптера, който използвате за комуникация с Mysql. Доколкото виждам, вие използвате PDO адаптер, за да извлечете резултата от заявката. Този адаптер обаче не поддържа частични секунди (ГГГГ-ММ-ДД ЧЧ:ММ:СС.F).
PDO адаптерът поддържа ГГГГ-ММ-ДД ЧЧ:ММ:СС и автоматично форматира стойността на колоните за дата и час в този формат.
Това е грешка в самия PDO адаптер. Моля, намерете връзката по-долу за справка:http://grokbase.com/t/php/php-bugs/11524dvh68/php-bug-bug-54648-new-pdo-forces-format-of-datetime-fields
