Тук ще отговоря сам на въпроса си. Проверих размерите на дяловете с обикновен df
команда и там можех да видя, че /var е 100% пълен. Намерих архив, който някой е оставил, който е с размер 10GB. Изтрих това, стартира MySQL, изпълни PURGE LOGS BEFORE '2012-10-01 00:00:00'
заявка, за да освободите натоварване от място и намали размера на директорията /var/lib/mysql от 346GB на 169GB. Променено обратно на главен и всичко отново работи отлично.
От това научих, че нашите регистрационни файлове стават МНОГО големи, МНОГО бързо. Така че ще установя рутина за поддръжка, за да не само поддържам регистрационните файлове, но и да ме предупреждава, когато наближаваме пълен дял.
Надявам се това да е от полза за някой в бъдеще, който се натъкне на това със същия проблем. Проверете вашето дисково пространство! :)