Проверете документи http://php.net/manual/en/ref.pdo -mysql.php .
По принцип имате нужда от:
PDO::MYSQL_ATTR_LOCAL_INFILE => true
Задава се при инстанциране.
Пример:
$conn = new \PDO("mysql:host=$server;dbname=$database;", "$user", "$password", array(
PDO::MYSQL_ATTR_LOCAL_INFILE => true,
));