Ако вашият MySQL клиент/сървър версия е 5.6.x начин да избегнете съобщението ПРЕДУПРЕЖДЕНИЕ, използвайте mysql_config_editor инструменти:
mysql_config_editor set --login-path=local --host=localhost --user=username --password
След това можете да използвате във вашия шел скрипт:
mysql --login-path=local -e "statement"
Вместо:
mysql -u username -p pass -e "statement"