Можете да използвате нотация с точки, за да актуализирате вложения документ. Имайте предвид, че когато се използва нотация с точка, тя трябва да се постави между кавички.
db.collection.update(
{},
{ $set:{
"codeId.$ref":"code"
}
},
false,
true
);
Можете да прочетете повече за Референции на бази данни .