db.collection('articles')
.find( {"_id.$oid": id} )
.
или дори по-конкретно:
db.collection('articles')
.findOne( {"_id.$oid": id} )
.
РЕДАКТИРАНЕ:
Преобразуване на низ в тип ObjectId преди запитване
var ObjectID = require('mongodb').ObjectID;
db.collection('articles')
.findOne( {"_id.$oid": new ObjectID(id)})
.
Справка:Ако имам идентификатор на mongo документ като низ, как да направя заявка за него като _id?