Ако искате да използвате native(), винаги можете да опитате същата заявка директно във вашата mongo-DB. Тъй като _id е Object-id, трябва
var ObjectId = require('mongodb').ObjectID;
User.native(function (err, collection) {
collection.update({_id: new ObjectId(anIdVariable)},{$push:{pubs:aPubsVariable}}, function (err) {
});
Можете да добавите mongo-native-driver към вашето приложение с npm install mongodb --save