Mongoose се опитва да зададе ObjectId по подразбиране. Можете да потиснете това със следното:
var categorySchema = mongoose.Schema({
_id: String,
ancestors: [{type: String }],
parent: {type: String}
},{ _id: false });
var Category = mongoose.model( "Category", categorySchema );
И отбелязвайки, че има само една схема за вашето оформление.