За да актуализира документ, MongoDB трябва да извлече целия документ от диска (освен ако вече не е в кеша), след това да го промени в паметта и да го запише обратно на диска. Модификациите също се записват в oplog за репликация към вторичните възли.
С нарастването на размера на документа това ще отнеме повече време за всеки документ и тъй като всеки документ заема все повече място в паметта, изтичането на кеша също ще започне да намалява производителността за несвързани заявки.
Максималният размер на документа в MongoDB е 16 MB. Ако този документ вече е на 4 MB след 10 минути, скоро ще трябва да бъде разделен или изрязан.