MongoDB включва прост профайлър. Вижте тук:http://www.mongodb.org/display/DOCS/Database+ Профайлър
Ако зададете ниво на профилиране на 2, тогава всички заявки ще бъдат записани в колекцията "system.profiler", така че можете да погледнете. Ако зададете ниво на профилиране на 1, тогава ще се записват само бавните заявки (по подразбиране те се дефинират като заявки, по-бавни от 100 ms, но това е конфигурируем параметър).
За диагностициране на бавни заявки, функционалността "обяснение" също е много полезна. Вижте тукhttp://www.mongodb.org/display/DOCS/Explain
Когато знаете кои заявки са бавни, можете да използвате обяснение, за да разберете кой индекс използва (или не използва) базата данни.