Мога да потвърдя, че определено е нещо с операционната система, тъй като актуализирах и се сблъсквам със същия точен проблем. В момента се ровя в него, ако намеря нещо, ще ви уведомя!
АКТУАЛИЗАЦИЯ:
След известно проучване изглежда, че това е свързано със зависимостта Go, която MongoDB използва. В момента MongoDB използва v1.4.2. Оказва се, че има проблеми с по-стари версии на Go на macOS Sierra. https://github.com/golang/go/issues/16570 обяснява, че проблемът е разрешен с v1.7. Освен ако няма начин да накарате MongoDB да посочи Go v1.7, не съм сигурен дали това ще бъде решено, докато MongoDB не надстрои техните зависимости.
АКТУАЛИЗАЦИЯ 2: Планирах да подам бъг с MongoDB във връзка с проблема, докато не попаднах на това... https://jira.mongodb.org/browse/TOOLS-1450 . Изглежда, че MongoDB 3.2.10 ще използва Go v1.7 и трябва да коригира проблемите, които вие и аз виждаме.