това, от което всъщност се нуждаете, е да архивирате старите данни. Предлагам ви да разгледате тази тема в пощенския списък на mongodb:
https://groups.google.com/forum/#!topic/mongodb-user/rsjQyF9Y2J4
Последната публикация от Майкъл Диролф (10 поколение) гласи:
така че предполагам, че можете да останете с една колекция и добрите индекси ще свършат работата.
така или иначе, ако колекцията стане твърде голяма, винаги можете да стартирате ръчен процес на архивиране.