MongoDB добавяне към полето за присъединяване на колекция от основното

Първо трябва да $unwind questions масив и след това трябва да приложите $lookup и накрая използвайте $group за да се върнете отново в масива.

db.games.aggregate([
  { "$unwind": "$questions" },
  { "$lookup": {
    "from": "questions",
    "localField": "questions.question_id",
    "foreignField": "_id",
    "as": "question_data"
  }},
  { "$unwind": "$question_data" },
  { "$addFields": {
    "question_data.position": "$questions.position",
    "question_data.question_id": "$questions.question_id"
  }},
  { "$group": {
    "_id": "$_id",
    "questions": { "$push": "$questions" },
    "question_data": { "$push": "$question_data" }
  }}
])