използвайте findOneAndUpdate() метод и в параметъра на заявката използвайте опцията като { "new":true}
return this.sessionModel
.findOneAndUpdate({user_id: data.user_id}, {$set:{session_id: suuid}}, { "new": true})
.exec()
.then(data=>{
return {
sid: data.session_id
}
})