Извадката е достъпна само от агрегиране. Трябва да започнете с Aggregate, а не с Find. Вярвам, че е наличен и в Linq.
АКТУАЛИЗАЦИЯ:Изглежда, че нямаме метод конкретно за това. Можете обаче да използвате метода AppendStage.
mongoCollection.Aggregate(sampleFilter)
.AppendStage<BsonDocument>("{ $sample: { size: 3 } }");