Вероятно този въпрос е свързан със следните грешки:
- Прекъснатата заявка за преброяване връща 0 като резултат от преброяването
- count командата връща нула в някои случаи на грешка, вместо да докладва грешка с ok:false
В моя случай (mongodb 2.0.1) беше свързано с повреда на базата данни. Вижте find().count() грешка?