MongoDB c# драйвер - Може ли поле, наречено Id, да не бъде Id?

Отговорът на въпроса ви е „да, но...“.

Това е възможно е да има член, наречен Id, който не е картографиран към елемента _id. Например:

public class X {
    [BsonId]
    public ObjectId MyId;
}

public class Y : X {
    public string Id;
}

В йерархията на клас обаче членът _id трябва да бъде в основата на йерархията (с други думи, всички членове на йерархията трябва да се съгласят да използват един и същ _id).