Късно проследяване на горния въпрос...
Имах подобен проблем след преместването на db към ebs на ec2.
Оказва се, че само стартирането на mongod все още насочва dbpath към /data/db/ (което съществува).
Файлът /etc/mongodb.conf
се игнорира напълно, освен ако не е специално насочен към.
Успявам да заобиколя това, като използвам директивата --config
или само --dbpath
(и двете работят) Но останах да се чудя откъде mongod взема настройките по подразбиране...?!
Не успях никъде да намеря и отменя тези настройки по подразбиране. Някой?
Забележка:Наистина съм раздразнен от това поведение на mongod... Това е просто лош дизайн и лоша документация.