Файловете .0, .1 са файлове с данни. Всеки файл с данни е предварително разпределен за определен размер. (Това се прави, за да се предотврати фрагментирането на файловата система, наред с други причини.) Първото име на файл за база данни е .0, след това .1 и т.н. .0 ще бъде 64MB, .1 128MB и т.н., до 2GB. След като файловете достигнат 2GB размер, всеки следващ файл също е 2GB. Информация относно файловете с данни може да се намери тук:
http://www.mongodb.org/display/DOCS/Excessive+Disk+Space
Файловете ".ns" са файлове с пространство от имена. Всяка колекция и индекс ще се считат за пространство от имена. Всяко пространство от имена е 628 байта, .ns файлът е 16MB по подразбиране.
По този начин, ако всяка колекция има един индекс, можем да създадем до 12 000 колекции. Параметърът --nssize ви позволява да увеличите това ограничение.
Максималният размер на файла .ns е 2 GB.