Използвам mongoose версия 1.2.0 и веднага щом създам нов екземпляр на модел мангуста, _id вече е зададено.
coffee> u = new User()
[object Object]
coffee> u._id
4dd68fc449aaedd177000001
Също така потвърдих това, след като извиках u.save() _id остава същото. Потвърдих чрез MongoHub, че това наистина е истинският идентификатор, запазен в MongoDB.