Това вече е възможно в по-новата версия на C# mongo драйвера (от 2.4.0).
Например, за да направите заявка към индекс, нечувствителен към главни букви:
IMongoCollection<SomeObject> someCollection;
var results = someCollection.Find<SomeObject>(x => x.name == someName,
new FindOptions() { Collation = new Collation("en", strength: CollationStrength.Secondary) } )
Забележете, че за да се насладите на силата на индекса, трябва да посочите в заявката точно същия параметър за съпоставяне, както е посочен при създаването на индекса.