Не е необходимо първо да използвате, за да извлечете документа, просто използвайте .update метод с $push оператор.
def update_tags(ref, new_tag):
coll.update({'ref': ref}, {'$push': {'tags': new_tag}})
Тъй като актуализацията е отхвърлена, трябва да използвате find_one_and_update или update_one метод, ако използвате pymongo 2.9 или по-нова версия