Mongoose винаги връща празен масив NodeJS

Извикването към mongoose.model установява името на колекцията, към която е свързан моделът, като по подразбиране е името на модела в множествена число, с малки букви. Така че с вашия код това би било 'models' . За да използвате модела с files колекция, променете този ред на:

var Model = mongoose.model("Model", fileSchema, "files");

или

var Model = mongoose.model("file", fileSchema);