Можете да използвате това:http://www.ozerov.de/bigdump/
Или
Използвайте тази команда, за да разделите sql файла
split -l 5000 ./path/to/mysqldump.sql ./mysqldump/dbpart-
Командата split взема файл и го разбива на множество файлове. Частта -l 5000 му казва да разделя файла на всеки пет хиляди реда. Следващият бит е пътят към вашия файл, а следващата част е пътят, по който искате да запишете изхода. Файловете ще бъдат запазени като име на файл, което посочите (напр. „dbpart-“) с добавена комбинация от букви по азбучен ред.
Сега трябва да можете да импортирате вашите файлове един по един чрез phpMyAdmin без проблем.
Повече информация http://www.webmaster-source.com/2011/09/26/how-to-import-a-very-large-sql-dump-with-phpmyadmin/
