Можете да настроите няколко екземпляра на mysql, но за вашата ситуация е по-добре да създадете различни бази данни в един и същи екземпляр.
Можете да създавате бази данни и след това да добавяте потребители, които имат достъп само да манипулират предоставената им база данни и нищо друго.
По същество иерархията е следната:
Mysql (root or any other super user can see everything)
- Your DB
- Your Users
- Your tables/functions/Procedures/etc
- Their DB
- Their Users
- Their tables/functions/procedures/etc.
Основно разделяте достъпа за всеки, а в PHPMyAdmin това е много лесно. Стъпките са:
- Добавяне на база данни )
- Добавете потребител, ограничавайки го до тази база данни, позволявайки само привилегиите, които искате да дадете на този потребител и само на тази база данни. (Ръководство тук )