Открих, че имам следната настройка в моя конфигурационен файл на phpMyAdmin, поставена от кой знае каква предишна корекция на производителността направих.
$cfg['MaxExactCount'] = 0
Това деактивира коригирането на оценките на InnoDB. Коментирах този ред и, разбира се, той се погрижи за проблема
