Един от поддържаните от SQLite формати за дата/час е Unix timestamps, т.е. секунди от 1970 г. За да конвертирате милисекунди в това, просто разделете на 1000.
След това използвайте функция за дата/час, за да получите годината и месеца:
SELECT strftime('%Y-%m', MillisField / 1000, 'unixepoch') FROM MyTable