Не може да се свърже със SQL Server с PHP

Опитайте „ConnectionPooling=0“ в DSN.

понякога работи и понякога връща грешка

Може да е проблем при повторното използване на връзката.

Справка за DSN:https://msdn.microsoft.com/en-us/library/ff628167(v=sql.105).aspx