Проблемът изглежда е в конфигурационния файл на MySQL за phpmyadmin PersistentConnections зададено на FALSE което доведе до нов CONNECTION_ID всеки път, когато е издадена заявка - следователно изобразяване на SELECT LAST_INSERT_ID() неефективно.
повече информация в следващата тема Всяка заявка създава нов CONNECTION_ID()
Също така благодаря dnagirl за помощ