Аз съм имал същия проблем. Доставчикът, който бях принуден да използвам, имаше само MyISAM и аз разработих в InnoDB. Възможно е да мигрирам, тъй като изглежда MyISAM игнорира всички FK команди, които използвате, когато създавате схемата.
Използвах просто експортиране от Mysql workbench и импортирах схема и съдържание в отдалечения хост.
Мисля, че ограниченията на базата данни ще бъдат запазени, тъй като разработих и тествах с помощта на InnoDB с FK проверка. Ако вашият код е стабилен, рискът базата данни да загуби целостта трябва да е минимален. Но разбира се може да има случаи на непредвидени проблеми с ключовете, ако не управлявате някои ограничения в кода си.
Общ преглед на InnoDB и MyISAM двигателите за съхранение могат да ви дадат отговора, ако сте разчитали на нещо друго, което отличава двете неща.
