опитайте това с инсталиран FWtool
ogr2ogr -f MySQL MySQL:database_name,host=localhost,user=root,password=1234 C:\route_path\line.shp -nln datatable_name -update -overwrite -lco engine=MYISAM
опитайте да инсталирате за по-добър резултат във всеки процес Osgeo4w
http://trac.osgeo.org/osgeo4w/