Решение:
За тези, които се сблъскаха със същия проблем - ето какво открих. Стартирах show variables like 'datadir'
и открих, че моите файлове с данни се съхраняват в друга папка:C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 5.5\data\
и първоначално заменях файлове в папка C:\Program Files.... Имаше и необходимите файлове.
Така че най-накрая всичко мина добре.