Актуализирайте колона, като използвате подзаявка за избор към същата таблица

Искате UPDATE FROM :

UPDATE N1
SET N1.is_last_child = 1
FROM Node N1
LEFT OUTER JOIN Node N2
    ON N1.ID = N2.Parent_ID
WHERE N2.ID IS NULL

Лявото външно съединение е концептуално същото като използването на NOT IN само че е по-лесно за четене и нямате нужда от куп вложени заявки.