Трябва да добавите @JoinColumn(name ="ID Column Name") анотация заедно с анотацията @ManyToOne или @OneToMany, както ZaoTaoBao спомена. Тази анотация определя името на колоната, която ще се използва като FK.
Обърнете се към тази връзка за повече подробности:http://docs .oracle.com/javaee/6/api/javax/persistence/JoinColumn.html