Най-бързото решение е, че имате нужда от "прекъсване " във вътрешния цикъл.
for ($i=0; $i < count($data)/3; $i++){
for ($j=0; $j<3; $j++){
if (($i * 3) + $j >= count($data)) {
break;
}
Обърнете внимание, че трябва да спестите малка част от изчислителната мощност, като съхраните count($data) в променлива - освен ако не очаквате броят да се промени.
$countOfData = count($data);
for ($i=0; $i < $countOfData/3; $i++){
for ($j=0; $j<3; $j++){
if (($i * 3) + $j >= $countOfData) {
break;
}