Добре, оценявайки всички параметри на групирането на връзки, изглежда validationQueryTimeOut причиняваше целия този проблем. След премахването на този параметър всичко е нормално. Сега работещите ми свойства за групиране на връзки са като тези
properties {
initialSize=5
maxActive=50
minIdle=5
maxIdle=25
maxWait = 10000
maxAge = 10 * 60000
timeBetweenEvictionRunsMillis=5000
minEvictableIdleTimeMillis=60000
validationQuery="SELECT 1"
validationInterval=15000
testWhileIdle=true
testOnBorrow=true
testOnReturn=false
jdbcInterceptors = "ConnectionState"
defaultTransactionIsolation = java.sql.Connection.TRANSACTION_READ_COMMITTED
}