Как да направите статуса на квадратчето за отметка отметнат или неотметнат въз основа на стойности на базата данни?

Опитайте

if($row->IsActive==1)
{
    echo '<td><input type="checkbox" checked="checked" name="status" id="status"/></td>';
}
else
{
    echo '<td><input type="checkbox" name="status" id="status"/></td>;
}