Лесен начин да направите това е да го добавите към пътя на Windows Environment (той е в пътя на повечето Unix системи). Тогава просто трябва да извикате mysql от скрипта.
Ето страницата с информация как да го направите от MySQL:Старт на MySQL Windows Service
И на тази страница искате да намерите текста
и прочетете този раздел. Използвайки този метод, вие просто трябва да извикате mysql без път.