Обикновено това се прави с помощта на транзакция. Редактирайте файла с всички INSERT. Добавете линия отгоре и отдолу:
BEGIN TRANSACTION;
-- all insert statements go here
COMMIT;
Сега, след като влезете в MySQL от командния ред, изпълнете
mysql> source file_name
Вижте тук за подробности.
