Вижте примера за AJAX във flot документацията .
По същество стъпките са:
1.) Изтеглете от базата данни.
2.) Поставете данни в PHP масив ключ/стойност на форма:
$dataSet1 = Array();
$dataSet1['label'] = 'Customer 1';
$dataSet1['data'] = Array(Array(1,1),Array(2,2)); // an array of arrays of point pairs
$dataSet2 = Array();
$dataSet2['label'] = 'Customer 2';
$dataSet2['data'] = Array(Array(3,3),Array(4,5)); // an array of arrays of point pairs
$returnArray = Array($dataSet1, $dataSet2);
3.) Обратно във вашия javascript, вземете този json кодиран низ като JS променлива:
var data = <?php echo json_encode($arr); ?>;
4.) Обратно във вашия javascript, извикайте метода flot plot с тази променлива с данни:
$.plot($("#placeholder"), data, options);