Вземете общо поле, групирано по дата, и друго поле

Използвайте SUM функция за сумиране count колона и използвайте DATE_FORMAT функция за групиране само по дата.

SELECT DATE_FORMAT(detectDate, '%Y-%m-%d') AS detectDate
      ,infection 
      ,SUM(`COUNT`) as `count`
FROM myTable
GROUP BY DATE_FORMAT(detectDate, '%Y-%m-%d'), infection

Вижте този SQLFiddle