Свойството, което трябва да зададете, е извикване "adonet.factory_class". Използвайте някое от следните:
<property name="adonet.factory_class">assembly-qualified-name</property>
или
configuration.SetProperty(
Environment.BatchStrategy,
typeof(MySqlClientBatchingBatcherFactory).AssemblyQualifiedName);
или както е отбелязано в readme на самия бачер (https://github.com/Andorbal/NHibernate.MySQLBatcher):
config.DataBaseIntegration(db =>
db.Batcher<MySqlClientBatchingBatcherFactory>());