Можете да пресъздадете функциите на mysql и да използвате mysqli в тях. Това не е наистина чисто, но ще работи и е бързо решение, докато не можете да преработите приложението си
Например:
function mysql_connect($host, $username, $password, $db) {
return mysqli_connect($host, $username, $password, $db);
}
function mysql_query($query){
return $mysqli_query($query);
}