Проблемът ви е повече от вероятно някои дистрибуции на Linux да имат различни php.ini за Apache PHP и и PHP-CLI, изглежда, че вашият PHP-CLI (който пекар за сладкиши ще използва) няма активирани функциите mysql_*.
За да коригирате, ще трябва да намерите php.ini за PHP CLI и да декомментирате реда, който включва mysql_* lib. трябва да бъде нещо като "extension=mysql.so". За да намерите местоположението на php.ini, изпълнете php -r 'phpinfo();'
в командния ред и превъртете до върха, за да видите местоположението на php.ini.