Знам, че вероятно сте се отказали от отговор, но...
Мисля, че ще откриете, че по-голямата част от допълнителното време е зареждането и компилирането на PHP скрипта. ако предишното ви приложение е било модул Apache, то е предварително компилирано и винаги се зарежда, вероятно написано на c толкова бързо в сравнение с PHP.
Опитайте да използвате php ускорител като eaccelerator. който използва споделена памет и предварително компилирани скриптове, за да подобри понякога драстично производителността на PHP приложенията.
DC
