За съжаление не мога да ви кажа защо, но изглежда е проблем с конектора MySql.
Добавете това:
.ExposeConfiguration(c => c.Properties.Add("hbm2ddl.keywords", "none"));
към вашата конфигурация и вижте дали помага. Намерих решението във форумите за хибернация .